عمل اللواء طارق مرزوق مساعد الوزير لقطاع السجون ، وكان عقيدًا بالإدارة العامة لمباحث الأموال العامة، ثم حصل على رتبة عميد وعمل نائبًا لمدير أمن أسوان في 2016 ، ثم تولى بعد ذلك منصب مدير قطاع شرق القاهرة .
وفي 25 يوليو 2019، اعتمد اللواء محمود توفيق، وزير الداخلية، حركة تنقلات واسعة، شملت تعيين اللواء طارق مرزوق ، حكمدارًا للقاهرة .
ومنذ توليه منصب حكمدار القاهرة، قبل انتقاله مديرًا لأمن الجيزة، أشرف اللواء طارق مرزوق، على العشرات من القضايا الكبيرة التي شغلت الرأي العام، والتي كان على رأسها حادث تفجير معهد الأورام.
ولعب اللواء طارق مرزوق، دورًا بارزًا في كشف العناصر والجماعات الإرهابية التي اتخذت من القاهرة ملاذًا لها للهروب من قبضة الأمن، وأشرف على فك لغز مئات القضايا المهمة.